Bodrum katları için dıştan yalıtım mümkün olmaması halinde iç taraftan yapılan su yalıtımı, negatif su yalıtımı olarak adlandırılmaktadır. Akan suya bile uygulanabilen bu yöntemle bina negatif su yalıtımının zararlı tesirlerinden korunabilmektedir.

Uygulama yapılacak yüzey yönündeki suyun oluşturduğu basınca pozitif, tersi yöndekine de negatif su basıncı denilir. Önce basınçlı suya karşı yalıtım yapılır, gerekirse üzerine rutubet yalıtımı maksadıyla izolasyon sıvası uygulanır.

Su yalıtımının sorun olması halinde, sorun bina içerisinden müdahale ile halledilir. Yapılan işlem negatif basınca karşı negatif su yalıtımıdır. Kat duvarları içten yalıtımı, asansör boşlukları, havuz dış duvarları, tüneller, temeller ve negatif su yalıtım duvarları en sık uygulama alanlarıdır.

Yalıtım tekniği, betonarme perde duvarlara kristal malzemeler ile suyun geldiği yönün tersi yönden yalıtım yapılması olarak özetlenebilir. Dışarıdan içeriye etki eden suyu önlemek, betonarme yapı içindeki kristalize malzemenin suya doğru gitmesini sağlamak ve çatlaklarda kristal üremesi sayesinde demir kısımları korozyona karşı korumak hedeflenir.